Através da mais moderna Clínica Odontológica do Rio de Janeiro (Segundo a Kavo – empresa focada em excelência dental), a Clínica Odontológica das Faculdades São José é voltada para a formação e aprimoramento técnico dos alunos de graduação em Odontologia. Além das aulas práticas, os alunos também fazem atendimento comunitário através da clínica aonde têm a oportunidade de desfrutar de uma completa infra-estrutura de aprendizagem, que inclui materiais e equipamentos para pronto-atendimento, emergência, esterilização, clínica e radiologia.